INSTIPER Press memiliki dua divisi yaitu :

  1. Penerbitan. Divisi penerbitan berperan dalam mengembangkan penerbitan di lingkungan Instiper. Didukung oleh sarana dan prasarana yang baik dan kualifikasi staff yang profesional, unit ini telah berkembang pesat, baik kualitas maupun kuantitas hasil cetakan. Tugas pokok divisi ini antara lain :
    1. Berkolaborasi dengan stake holder dalam menghasilkan materi publikasi yang berkualitas, terutama dari para peneliti/dosen dan mahasiswa
    2. Layouter naskah
    3. Proofreading naskah
    4. Membuat cover dan ilustrasi
    5. Administrasi dan Narahubung Instiper Press
    6. Promosi dan distribusi
    7. Digital marketing
    8. Melakukan kerja sama dengan penerbit lain
    9. Melakukan pengurusan ISBN
    10. Cetak buku dalam bentuk tercetak dan elektronik
  2. Publikasi Jurnal. Divisi ini membantu mengelola penerbitan jurnal ilmiah di lingkup Instiper Yogyakarta. Tugas pokok divisi ini antara lain :
    1. Administrasi dan Narahubung untuk 5 jurnal di Instiper
    2. Custom template jurnal
    3. Pengurusan DOI
    4. Mencari naskah jurnal eksternal
    5. Indexing jurnal
    6. Layouter Naskah
    7. Proofreading naskah
    8. Membuat cover dan ilustrasi
    9. Promosi dan distribusi
    10. Mengoordinasi kegiatan penerbitan karya ilmiah bagi dosen dan mahasiswa
    11. Melakukan kerja sama publikasi jurnal.

      12. Jurnal yang dikelolah oleh instiper press antara lain :

      1. Agroista: Journal Agrotechnology: Agroista diterbitkan oleh program studi Agroteknologi. Agroista merupakan sarana informasi ilmiah perkembangan ilmu Agroteknologi yang mencakup berbagai komoditas perkebunan dan pertanian yang berupa hasil penelitian ilmiah dan kajian teoritis
      2. Agrifitia: Journal of Agribusiness Plantation: AGRIFITIA diterbitkan oleh Program Studi Agribisnis Fakultas Pertanian INSTIPER. AGRIFITIA merupakan sarana informasi ilmiah perkembangan ilmu Agribisnis yang mencakup berbagai isu seputar perkebunan dan pertanian yang berupa hasil penelitian ilmiah dan kajian teoritis
      3. Biofoodtech: Journal of Bioenergy and Food Technology: merupakan sebuah jurnal ilmiah yang dipublikasikan oleh Program Studi Teknologi Hasil Pertanian INSTIPER , terbit secara berkala dua kali dalam setahun pada bulan April dan Oktober
      4. Wana Tropika: Wana Tropika pertama kali diterbitkan pada tahun 2011 oleh Fakultas Kehutanan, Institut Pertanian Stiper. Jurnal Wana tropika, menerbitkan makalah penelitian primer, artikel ulasan, analisis kebijakan dan catatan penelitian dan hasil awal di semua bidang kehutanan